Guarda io personalmente uso naviga3, e tengo sotto controllo le soglie con DU meter e non ho mai avuto addebiti indebiti fortunatamente...

Dunque non saprei dirti esattamente dove cercare i tuoi file di log.
Comunque di solito sono facilmente trovabili.
I file di log solitamente sono dei file di testo .txt dove i programmi stilano una specie di "report" di ciò che fanno.
Per esempio nel file di log di un antivirus troverai il dettaglio del risultato di una scansione del pc con l'elenco dei virus trovati e delle azioni intraprese.

Nel tuo caso dovresti trovare lo storico connessioni con le date, gli orari e il traffico effettuato.
Presumo che il software della 3 crei dei file di log cifrati per evitare che possano essere manomessi, e per essere usati come "prova" quando si vuole essere rimborsati.

P.S.: ma per curiosità, hai guardato su infocosti per vedere come mai ti hanno addebitato quella cifra?