Beh, direi che puoi tranquillamente disinstallare l'immagine del vecchio kernel, che non ti serve più. Lo fai comodamente da Synaptic, liberi spazio e ti aggiorna automaticamente Grub.
Ma poi tu non hai un K7 o PIV ora? Che ci fai col Kernel 386? Ti converrebbe mettere quello ottimizzato per K7 o 686.