Io ho notato differenze sul link delle applicazioni solo quando l'iPhone è collegato... nel senso che il link applicazioni lo trovo sempre sotto "libreria" (dopo musica, film, programmi tv e podcast) ma con la versione precedente, quando collegavo l'iPhone mi compariva il link "applicazioni" anche sotto la sezione "iPhone" mentre adesso non compare più e per vedere le applicazioni installate nel telefono devo selezionare il link del telefono stesso (una volta collegato) e navigare sulla parte destra il dettaglio delle varie sezioni (tra le quali c'è anche "applicazioni" con la spunta su quelle installate).
Per quel che riguarda la segnalazione delle applicazioni da aggiornare... se clicchi sul link "applicazioni" nella sezione "libreria" a destra ti compaiono tutte le applicazioni caricate e in basso a destra dovresti avere i due link "verifica aggiornamenti" e "scarica altre applicazioni"...